歩行撮影時にジャイロ線が途中でズレてしまった場合、撮り直した方が良いのでしょうか？

分析精度上、ずれないように撮影できる方がより正確な測定は可能です。
ただし、ずれていても分析自体は可能ですので、あくまで可能な範囲で構いません。